以下是一些常用的蛋白相互作用预测网站和工具,它们可以帮助科学家们预测蛋白质之间的相互作用:
1. STRING (https://string-db.org/)
- STRING 是一个公共数据库,提供了已知和预测的蛋白质-蛋白质相互作用信息,支持多种生物物种,并整合了实验数据、计算预测和公共数据库的结果。
2. BioGRID (https://thebiogrid.org/)
- BioGRID 是一个全面的生物相互作用数据库,提供了来自文学和实验研究的蛋白质相互作用数据,支持多种生物体。
3. IntAct (https://www.ebi.ac.uk/intact/)
- IntAct 提供了一个相互作用数据库,专注于直接的蛋白质相互作用,其数据来源主要是通过实验得来的。
4. Cytoscape (https://cytoscape.org/)
- Cytoscape 是一个开放源代码的软件平台,可以用于可视化复杂的网络和集成这些网络的多种数据,包括蛋白相互作用。
5. PredictProtein (https://predictprotein.org/)
- PredictProtein 是一个用于预测蛋白质结构和功能的在线工具,其中也包括了对蛋白质相互作用的预测。
6. PIP (Protein Interaction Predictor) (http://pip.ebi.ac.uk/)
- PIP 是一个蛋白质相互作用的预测工具,基于蛋白序列和其它特征进行相互作用的预测。
7. iProX (https://www.iprox.cn/)
- iProX 是一个集成的蛋白质组学数据共享和分析平台,可以用于蛋白质相互作用的研究。
这些工具和数据库各有特色,您可以根据具体的研究需求选择合适的工具进行蛋白质相互作用的预测和分析。
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